一名学生说: “与其他学校相比，佩珀代因的学生通常拥有更强的宗教基础，因此具有高标准的道德操守。In comparison to other
schools, Pepperdine students generally have a more religious foundation and thus
have high standards of moral integrity.”
1937年2月，经济大萧条背景下，西部汽配公司的创始人、基督教会终身成员乔治·佩珀代因(George Pepperdine)在洛杉矶市设立了以自己名字命名的基督教文理学院，由于乔治是一名商人，通过其邮购汽车零部件供应公司积累了大量的财富。
同年9月，来自22个不同州和2个其他国家的167名新生入读洛杉矶中南部的新校区(后来被称作佛蒙特大道校区)。1938年4月，学院得到了西北部大学协会的认证。
1960年代，学院面临着三重问题——佛蒙特大道校区周边出现了各种犯罪及城市衰退、风起云涌的民权运动在当地社区里又引发了一系列紧张局势、校区周边可供扩张的空间也捉襟见肘起来。1967 年学校开始计划迁移本科校区。在马里布((Malibu)附近拥有数百英亩土地的Adamson-Rindge家族提出捐赠零点五五平方公里土地。虽然该地位于山地，建造成本堪虑，但考虑到它优越的地理位置和周边富人区潜在的捐赠潜力，学校最终决定搬迁至此。新校区1971年4月开始动工，于来年9月正式接收第一批学生。
教会对学校有着深远而持久的持续影响，这种影响遍及校园生活的方方面面，比如禁止异性成员在宿舍过夜和要求学生每学期参加14次宗教集会(后者类似于类似于教堂)等。
佩珀代因本科学院——希维尔学院(Seaver College)的学生也必须修读三门宗教课程。虽然校方明令禁止在校园内饮酒，但学校现在已经取消了舞蹈禁令而且允许学生在宗教集会时自行选择座位。虽然这样的限制会让一般人都受不了，但佩珀代因大多数人还是很喜欢“一切以道德为准”的氛围。
管理系是佩珀代因最强大和最受欢迎的院系，它也在一定程度上定下了学校偏商科基调。那些希望获得高等商业教育的人可以报名参加B.S./M.B.A.双学位计划，在五年内获得希维尔学院国际商务或会计学学士学位以及大学研究生商学院的M.B.A.学位。
拥有广告、公共关系和新闻等专业和广播及电视广播工作室的传媒系也受到高度赞誉。据学生说，这里的心理学、经济学、生物学和计算机科学都很强大。
此外，在本科阶段很少见的运动医学专业也相当受欢迎和推崇。
